Po více než padesát let se mohl ostrov Philae, ležící uprostřed Nilu nedaleko prvního kataraktu, pyšnit svými velkolepými památkami vždy jen krátkou část roku. Po zbytek času byly monumenty zatopeny vodami staré asuánské přehradní nádrže. Marné byly protesty egyptologů i vlastních egypťanů. Problém byl zdárně vyřešen až v době, kdy se objevila další komplikace - stavba nové, ještě vyšší přehrady, která přidala celé věci na naléhavosti. Hladina vody mezi oběma přehradama, kde se nacházel i ostrov Philae, by totiž už vůbec neklesala a tak by bylo veškeré umělecké dědictví ostrova navždy ztraceno. A tak byly zahájeny práce na rozebrání chrámu (stejně jako v případě Abu Simbelu) a v listopadu 1976 již pět tisíc kamenných kvádrů čekalo v bezpečí na opětovné sestavení. Novou lokalitou se stal ostrov Agilka, který bylo třeba zvýšit a rozšířit, aby mohla být celá památka správně umístěna. Rekonstrukce skončila v roce 1979.

Vraťme se ale na počátek stavby chrámu. Nejstarší části pocházejí ze 4.století př.n.l., ale většina chrámu byla zbudována Ptolemáiovci a později Římany po 3.století př.n.l.Po příchodu křesťanů se z některých síní staly kaple a na ostrově vznikly i kostely. Další vandalství mají na svědomí i první muslimové. Původně byl chrám zasvěcen bohyni Isis a bohům Usírovi a Horovi. Isis byla egyptská bohyně zdraví, čistoty a mateřství. Když byl její muž Usíres zabit svým bratrem Sethem a Isis hledala části jeho těla, aby jej mohla oživit, právě na ostrově Philae prý našla Usírovo srdce.

Loď, která odjíždí od malé asuánské přehrady na ostrov Agilka, zastavuje u Nectabenovy haly na jižním okraji ostrova. Toto je nejstarší část chrámu. Cesta odtud vede přes vnější nádvoří kolem Imhotepova chrámu až k prvnímu 18 metrů vysokému pylonu. Po obou stranách nádvoří stojí sloupořadí. Na prvním nádvoří vidíme vlevo Dům zrození zasvěcený Horovi. Druhý pylon je vstupní barnou do svatyně Isis. Na západní straně najdeme Usírův pokoj. Na stěnách můžeme vidět reliéfy znázorňující Isis, jejího muže i syna a také Ptolemáiovce a Římany, kteří chrám stavěli. Za zmínku ještě určitě stojí chrám bohyně Hathor, který stojí východně od chrámu Isis, a kde najdeme na stěnách reliéfy hudebníků.